Орден 66 был приказом, который канцлер Палпатин дал Великой Армии Республики в Эпизоде ​​III: Месть Ситхов. Это был один из нескольких распоряжений на случай непредвиденных обстоятельств, которые были даны солдатам-клонам, которым они обучались, чтобы безоговорочно выполнять их в случае чрезвычайной ситуации. Приказ 66, который мог быть исполнен только по прямому приказу Палпатина, призывал солдат-клонов убивать своих лидеров-джедаев. Якобы для предотвращения поворота джедаев против Республики, Орден 66 был действительно планом Палпатина по уничтожению Ордена джедаев, чтобы ситхи могли взять власть.

Во Вселенной: Порядок 66 гласит:

В случае, если офицеры джедаи действуют против интересов Республики, и после получения конкретных приказов, подтвержденных как поступающие непосредственно от Верховного главнокомандующего (канцлера), командиры ГАР отведут этих офицеров смертельной силой, и командование ГАР вернется к Верховный главнокомандующий (канцлер) до создания новой структуры командования.

Когда был издан Приказ 66, ряд солдат-клонов посчитали его ложным и начали защищать джедаев, а не убивать их. Несколько других джедаев выжили, убив атакующих солдат-клонов.

Дарт Вейдер возглавил кампанию, чтобы выследить и убить большинство выживших в годы, следующие за Приказом 66. Это имперское уничтожение джедаев известно как Великая чистка джедаев. Более 100 джедаев и бывших джедаев скрылись и пережили всю чистку; например, Йода и Оби-Ван Кеноби выжили, отправившись в изгнание на отдаленные планеты Дагоба и Татуин.